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擁有陜西省果蔬深加工工程技術研究中心、陜西省食品綠色加工與安全控制工程實驗室、中俄食品與健康科學國際聯合研究中心、陜西省農產品貯藏加工危害因子風險評估實驗室四個省部級研究基地與平臺。

中國農業科學院農產品加工研究所是根據科技部、財政部、中編辦國科發政字[2002]356號文件精神，在中國農業科學院原子能利用研究所學科調整基礎上新組建的研究所，是中國農業科學院下屬的唯一從事以食品為主的農產品加工技術研究與開發的國家級科研機構。

中國肉類食品綜合研究中心是國內唯一的肉類食品專業性研究機構，是亞洲科研力量最為雄厚的肉類研究機構之一，常設國家肉類加工工程技術研究中心、國家肉類加工技術研發分中心、國家肉類食品質量監督檢驗中心、建設項目環境影響評價中心、亞太地區肉類科技培訓中心、國家肉禽蛋標準化委員會畜肉制品分技術委員會秘書處、肉類加工產業技術創新戰略聯盟理事長單位及秘書處、國家農產品加工技術研發體系肉蛋制品加工專業委員會主任委員單位、中國創新驛站、肉類加工技術北京市重點實驗室、北京市食品質量監督檢驗三站等機構。